La FIFA comunicó en su sitio oficial el nuevo formato de la Copa Intercontinental, y allí especificó la lista de todos los campeones a lo largo de los años. Lo que llamó la atención es que no figuran los títulos de Boca que obtuvo en el 2000 y el 2003, tras derrotar al Real Madrid y al Milan, respectivamente.

En 1960, con el nacimiento de la Copa Libertadores, se comenzó a disputar la Copa Intercontinental, que enfrentaba al campeón de América (Conmebol) con el campeón de Europa (UEFA). Salvo las excepciones de 1975 y 1978, se jugó ininterrumpidamente hasta 2004, aunque la FIFA no reconoce oficialmente las últimas cinco ediciones.


Esto es porque en el año 2000 se estrenó el Mundial de Clubes, que tuvo una primera edición inédita con una final entre brasileños: Corinthians venció a Vasco da Gama luego de que Real Madrid quedara eliminado y hasta perdiera por penales el duelo por el tercer puesto ante Necaxa. Ese mismo año 2000, Boca le ganó la final al Real Madrid por 2-1, en la victoria más importante de la historia del club. Sin embargo, esa Copa Intercontinental no se considera oficial de FIFA, ya que el título mundial le fue otorgado a Corinthians.

El Mundial de Clubes no se volvió a jugar hasta 2005, y por eso la FIFA considera que los títulos mundiales de 2001 a 2004 quedaron vacantes. En ese período, Boca volvió a ganar otra Intercontinental, en 2003, cuando derrotó a Milan por penales tras el 1-1 de los 120 minutos. Ese título tampoco tiene el aval oficial como campeonato del mundo, según la FIFA.